PiscAmp

PiscAmp

Cette interface vous permet d'essayer les fonctions d'alignement multiple de la bibliothèque PiscAmp. Lien vers GenieGen 2. Lien vers la Forge des communs numériques éducatifs. Lien vers le blog de Bioinformatique.

 
 
 
 

Légende :

  • Nature :

  • 🧬 ADN
  • ✉️ ARN
  • 🥩 Protéines
  • Comparaison :

  • * Identité
  • . Différence
  • Bases azotées :

  • A Adénine
  • T Thymine
  • C Cytosine
  • G Guanine
  • U Uracile
  • Acides aminés :

  • RKH Chargés positivement (hydrophiles)
  • DENQ Amides ou chargés négativement (hydrophiles)
  • FYW Aromatiques non chargés (hydrophobes)
  • LVMI Aliphatiques (hydrophobes)
  •  
  • AG Minuscules et hydrophobes
  • ST Ayant un groupe hydroxyle (petits et hydrophiles)
  • C Très conservé, capable de former des ponts disulfures
  • P Très conservé, conformation spéciale très rigide

Console

À propos

PiscAmp (Partitionnement par Identification des Sous-chaines Communes et Alignement Multiple Progressif) est une bibliothèque d'alignement multiple progressif écrite en JavaScript. Vous pouvez intégrer PiscAmp gratuitement à votre site Internet ou à votre application en citant simplement l'origine de la bibliothèque. L'algorithme de PiscAmp peut aussi être analysé à des fins pédagogiques par les étudiants en bioinformatique. Dernière mise à jour : .

Auteur : Damien Aubert Pennequin.Email de l'auteur

icône de licenceLicence : La bibliothèque et le démonstrateur PiscAmp sont distribués sous licence GNU GPLv3. Cette licence vous autorise à utiliser, copier, étudier, modifier et redistribuer ce logiciel, à condition que toute version modifiée ou dérivée soit diffusée sous la même licence et que le texte intégral de la licence soit fourni lors de toute redistribution. Pour plus de détails sur vos droits et obligations, veuillez consulter le fichier LICENSE ou le texte intégral à l'adresse https://www.gnu.org/licenses/gpl-3.0.html.

Code source : Tous les fichiers du code source de la bibliothèque et du démonstrateur de PiscAmp sont disponibles sur ce dépôt de la Forge des communs numériques éducatifs.

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