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À propos de moi

Je suis professeur agrégé en Sciences de la Vie, de la Terre et de l'Univers (SV-STU) depuis 2011. J'enseigne les Sciences de la Vie et de la Terre (SVT) et les Sciences Numériques et Technologie (SNT) au lycée d'enseignement général public Jeanne d'Arc à Clermont-Ferrand depuis 2016.

Je suis passionné par la biologie, et les sciences de l'évolution en particulier. J'ai aussi comme centres d'intérêt l'informatique, les mathématiques, la philosophie, la linguistique, la géologie, la vulgarisation scientifique et les sciences de l'éducation. Je suis ainsi l'auteur de plusieurs articles de recherche ou de vulgarisation, de même que d'un livre sur la systématique évolutionniste. Je suis aussi adhérent à la Société Française de Bioinformatique et je rédige des articles pour le blog participatif de bioinformatique francophone Bioinfo-fr.net.

J'ai programmé plusieurs applications Web :

• PhyloGraphe peut servir de support interactif à l'enseignement de la phylogénétique, du collège à l'enseignement supérieur, à l'aide d'exercices et d'activités plus complètes exploitant une large choix de données morphoanatomiques et moléculaires (ADN, protéines).
• Insélect' est un jeu éducatif permettant de mieux comprendre le concept de sélection naturelle au collège et au lycée ; les élèves y sont invités à jouer le rôle d'un prédateur chassant des insectes de différentes couleurs.
• Un Convertisseur de Bases permettant de convertir des nombres d'une base vers une autre. L'utilisateur peut choisir d'effectuer des conversions entre des bases classiques comme les bases décimal, binaire et hexadécimal, mais peut aussi spécifier une base personnalisée avec n'importe quels caractères de l'Unicode (y compris des émojis). Cette application est principalement destinée aux élèves de SNT et de NSI.

Évoluscope, c'est le nom de mon site mais c'est aussi le nom de ma chaine YouTube que vous pouvez retrouver à l'adresse suivante : Chaine Évoluscope 📺

Enseignement

Les Sciences numériques et technologie (SNT)

• Fascicule de SNT, version élève 2024-2025 (exercices et TP)

L'orientation en Première et Terminale

• SVT : pour faire quoi ?

Diaporamas de cours diffusés en classe de Première Spécialité SVT

• CHAPITRE I : La transmission et l'origine des caractères
  • Leçon 1 : Les gènes et les caractères.
  • Leçon 2 : Les rôles des protéines.
• CHAPITRE II : Les enzymes
  • Leçon 3 : Le mode d'action des enzymes.
  • Leçon 4 : Les enzymes dans le métabolisme.
• CHAPITRE III : Les cycles cellulaires chez les eucaryotes
  • Leçon 5 : La réplication de l'ADN.
  • Leçon 6 : La mitose.
  • Leçon 7 : La méiose.
• CHAPITRE IV : Les mécanismes de l'expression génétique
  • Leçon 8 : Les ARNm, des messagers de l'information.
  • Leçon 9 : Le code génétique et la traduction.
• CHAPITRE V : Mutations et évolution
  • Leçon 10 : Les mutations et les mutagènes.
  • Leçon 11 : Lignées germinales et somatiques, et sélection naturelle.
  • Leçon 12 : Génome humain et histoire humaine.
• CHAPITRE VI : Le système immunitaire humain
  • Leçon 13 : L'immunité innée.
  • Leçon 14 : L'immunité adaptative cellulaire.
  • Leçon 15 : L'immunité adaptative humorale.
  • Leçon 16 : Les vaccins et l'immunothérapie.
• CHAPITRE VII : Les maladies génétiques
  • Leçon 17 : Les maladies monogéniques.
  • Leçon 18 : Les maladies héréditaires multifactorielles.
  • Leçon 19 : Les cancers.
• CHAPITRE VIII : L'humanité et les écosystèmes
  • Leçon 20 : La dynamique des écosystèmes.
  • Leçon 21 : Les services écosystémiques.
• CHAPITRE IX : La croute terrestre
  • Leçon 22 : Les reliefs de la croute terrestre.
  • Leçon 23 : Le contraste pétrographique océan/continent.
• CHAPITRE X : La structure de la lithosphère
  • Leçon 24 : Les séismes et les ondes sismiques.
  • Leçon 25 : Les discontinuités superficielles de la Terre.
  • Leçon 26 : La mobilité horizontale de la lithosphère.
• CHAPITRE XI : La convection mantellique
  • Leçon 27 : Le modèle PREM.
  • Leçon 28 : Le moteur de la tectonique des plaques.
• CHAPITRE XII : La formation du domaine océanique
  • Leçon 29 : L'accrétion océanique.
  • Leçon 30 : La vitesse d'expansion océanique.
• CHAPITRE XIII : La formation du domaine continental
  • Leçon 31 : Les métamorphismes des roches océaniques.
  • Leçon 32 : Le magmatisme des zones de subduction.
  • Leçon 33 : La collision continentale.

Documents pour mes élèves de Première Spécialité SVT

• Fascicule de Première Spécialité SVT, version élève 2024-2025 (méthodes, cours, exercices, TP)
• Présentation de Rentrée 2024 (1^re Spé SVT)
• Rappels de Méthodologie pour les DS
• Clé d'identification des minéraux au microscope polarisant
• Un exemple de protéines ayant un rôle dans la structure et la mobilité des cellules : Le mécanisme moléculaire de la contraction musculaire
• Un exemple de mécanisme catalytique : Les protéases à sérine
• Animation 3D : La réplication de l'ADN
• Animation 3D : La condensation de l'ADN et la mitose
• Animation 3D : La transcription de l'ADN en ARNm
• Animation 3D : La traduction de l'ARNm en protéine
• Une expérience d'évolution : Film de la croissance des populations bactériennes antibiorésistantes

Vidéos de vulgarisation complémentaires à mes cours de Première Spécialité SVT

MIEUX APPRENDRE & ÉTUDIER : les (vraies) techniques scientifiques Cette lutte microbiologique que nous perdons - DBY #56 Histoire génétique et linguistique des peuples du Monde PNN 22 - De quoi nous protègent les vaccins obligatoires ? Biodiversité MaP#32 Le recyclage du plastique est-il automatique ? L'Argumentarium #9 La Corse arrachée à la France ? - Sous Nos Pieds #5

Logiciels

Vous pouvez accéder à mes applications web à l'aide des liens ci-dessous.

PhyloGraphe

Logiciel pédagogique (collège, lycée, enseignement supérieur) d'analyse phylogénétique incluant la manipulation de matrices de caractères, la construction d'arbres phylogénétiques et de groupes emboités, et le traitement des données moléculaires. PhyloGraphe succède à Phylogène.

Accès sur mon site perso

Insélect'

Jeu sérieux pour le collège simulant le mécanisme de la sélection naturelle. L'élève joue le rôle d'un prédateur chassant des insectes colorés dans une diversité d'environnements.

Accès sur mon site perso

Convertisseur de Bases

Application en ligne permettant de convertir un nombre d'une base à l'autre. Une base est le nombre symboles uniques utilisés dans l'écriture des entiers naturels dans un système de notation positionnelle. Ces symboles sont appelés des chiffres. En plus des bases classiques (décimal, binaires, hexadécimal), l'utilisateur peut choisir une base personnalisée.

Accès sur mon site perso

Publications

Voici la liste de mes publications. Vous pouvez aussi les consulter sur mon profil ResearchGate.

• Aubert D. (2023) Il ne faut pas polariser les caractères ! Biologie Géologie, 3-2023(409):85-103.
• Suing G. & Aubert D. (2018) Évolution : vers une approche dialectique. Biologie Géologie, 4-2017(386):141-155.
• Aubert D. (2017) Classer le vivant - Les perspectives de la systématique évolutionniste moderne. Éditions Ellipses, 498 pages. Acheter ce livre
• Aubert D. (2017) A simple parsimony-based approach to assess ancestor-descendant relationships. Ukrainian Botanical Journal, 74(2):103-121.
• Aubert D. (2016) Doit-on parler de « nomenclature binomiale » ou bien de « nomenclature binominale » ? La banque des mots, 91:7-14.
• Aubert D. (2016) Une nouvelle mégaclassification pragmatique du vivant. Medecine/sciences, 32(5):497-499.
• Aubert D. (2015) A formal analysis of phylogenetic terminology: Towards a reconsideration of the current paradigm in systematics. Phytoneuron, 2015-66:1-54.
• Masse I., Barbollat-Boutrand L., El Kharbili M., Berthier-Vergnes O., Aubert D. & Lamartine J. (2013) GATA3 inhibits proliferation and induces expression of both early and late differentiation markers in keratinocytes of the human epidermis. Archives of Dermatological Research, 306(2):357-361.

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